Als enige organisatie in de Bloemenveiling Aalsmeer heeft Flowerport Logistics een douane entrepot type C. Dit houdt in dat Flowerport Logistics vrije handelsgoederen kan inklaren op haar eigen terrein waardoor de logistieke snelheid enorm wordt vergroot. Verder heeft Flowerport Logistics als groot voordeel dat haar vrachtwagens en loslocatie geschikt zijn voor vliegtuigplaten waardoor de goederen snel in een koeling of tijdelijke opslag kunnen worden gezet tot ze zijn ingeklaard.

Het inklaren van goederen kan bij Flowerport Logistics 24uur, 7 dagen per week.